敦煌素有“善国神乡”之誉，晚唐至宋代沿鸣沙山北麓，西起月牙泉，东至莫高窟，三里一座庙，五里一道桥，塔寺林立，袈裟遍布，但直至清代，敦煌始有雷音寺的名称，其故址在莫高窟。据专家推测，应该是移民之后，民众不知“莫高窟”之名，见其佛窟纵横，宝相庄严，遂以熟知的《西游记》中“雷音寺”一名称之。 这从莫高窟曾有一清代牌匾“雷音禅林”可作为佐证之一。又据《甘肃通志》（乾隆元年成书）卷十二载：“雷音寺，在沙州卫（今敦煌市）城南三十里，即千佛洞。创始未详。有断碣云唐年（年号数字剥落）重修，疏岩凿石，佛龛层叠，塑像绘画以数万计。明时回人蹂躏，佛像毁坏，龛为沙掩，画壁犹存。今人民繁庶，道人等疏爬始见。每年四月八日香火甚盛。” 1944年2月1日，国立敦煌艺术研究所成立，罢废莫高窟雷音寺，就其址设国立敦煌艺术研究所。
1989年，敦煌市佛教协会谋建雷音寺，鉴于莫高窟为国家重点文物保护单位，且已列入“世界文化遗产名录”，故莫高窟区域 不可再建佛寺。而鸣沙山的美丽传说中，也有沙埋佛寺，故而沙山雷震不已的传说。故而选址在敦煌城南鸣沙山下重建雷音寺，1991年6月落成开光。开光之后，雷音寺名扬海内外，韩国佛教界朋友捐助修建了围墙，缅甸华侨捐赠了玉佛，台湾赠送《大藏经》，香港和上海居士共同修建了山门。使寺院形成了山门、天王殿、大雄宝殿三进院落的布局。2008年前，又对雷音寺进行了全面扩建，大雄宝殿之后的一系列建筑都属于扩建工程。
尽管属于移建，但雷音寺的根源与莫高窟一脉相承，可追本于西晋之“仙岩寺”，历十六国、北魏、西魏以迄北周；隋、唐则名“崇教寺”，五代及宋名“大圣仙岩寺”，元、明则为“皇庆寺”， 清代始名“雷音寺”。时异世迁，兴隳有间，寺名迭替，址有迁移， 而终得传呗十余朝代、继薪千七百余年，亦可谓源远流长、光前裕后矣！
1991年，雷音寺落成，法幢宗融照法师题写了“大雄宝殿”镏金巨匾。1992年，全国政协副主席、中国佛教协会主席赵朴初先生题写“雷音寺”寺名，现悬挂于寺院正门口。启功先生题写了“三洲感应”匾额。山门背面悬挂的匾额是2003年8月15日十一 世班禅大师额尔德尼•确吉杰布来雷音寺礼佛时所题写的。寺内还留存有许多道古匾，颇值得鉴赏。
进入雷音寺，首先呈现在眼前的是天王殿，天王殿正面供奉的是弥勒菩萨，肚腹宽大展现了菩萨的广大胸襟，笑口常开体现了菩萨的解脱自在。提醒着终日追求财色名利，繁忙不休的世人，只要放下执著，便会达成自己的心愿。弥勒菩萨两侧是四大天王。
天王殿背面供奉着神情威严，勇猛无畏的韦驮菩萨，他担当着驱除邪魔、护持正法的重任。两位菩萨截然不同的神态和表情，时刻警策着一个人要想获得成功，在待人、处事、接物上首先应宽以待人，严以律己。
原建于1991年的正殿一大雄宝殿是西北地区民间传统的古建殿堂，两边是罗汉堂。大雄宝殿正中供的是佛祖本师释迦牟尼佛， 左右两边是消灾延寿药师佛和南无阿弥陀佛，这三尊佛称之为三世佛，最边上是文殊菩萨和普贤菩萨。两边墙壁上画着释迦牟尼佛八相成道的壁画。这八幅图完整地描述了佛祖普度众生的光辉历程。 这座殿是以前寺院每天做早晚功课的地方。
大雄宝殿之后，便是2008年后扩建的一系列建筑。2007年起，雷音寺主持道证法师带领寺院两序大众发起了“恢复西天古雷音”的宏愿，按照莫高窟172窟《西方净土变》壁画布局对雷音寺进行整体的规划设计，在原址上进行扩建。自2008年开工建设以来，工程以纯宗教理念，摒弃商业化运作，完全依靠四众弟子的力量进行建设。到现在，雷音寺内建筑雄伟庄严，杨柳婆娑，松柏常青， 环境优美。
整座寺院现占地180亩，分为朝拜区、莲友修行区、闭关体验区等区域，大光明殿、钟鼓楼、接引长廊、南北配殿等主要殿堂均为唐式古建。全部采用砖木结构，整座屋架不用一根铁钉，都是铆隼结构。大光明殿为唐式重檐庑殿，四周拔廊，整座大殿建筑面积是1600平方米，是全国最大的传统大木屋架殿堂之一，现已成为雷音寺举办佛事活动的主场所。
大光明殿正中供五方五佛，源自密宗金刚界思想，东南西北中五方，各有一方主持，每一尊佛代表一种智慧，又称是“五方五智佛”。五方佛在佛教中表达着佛法无边，佛门广大之意。即佛在时空上无所不在，无处不有，周遍于一切事物。此五智虽为一身所具之智德，而为摄引众生，自本体出生四方之四智四佛，用眷属四佛 而阐释法身佛。五方佛两侧是24个护法神，又称之为“二十四诸天”，佛教徒虽不皈依诸天，然礼敬诸天，这是因为诸天皈命佛，且奉行正法，修诸善业，不作恶业。
大光明殿两边是接引长廊，连接着唐式钟鼓楼。院子两边是仿五台山佛光寺东大殿的琉璃宝殿及极乐宝殿，整座屋架也全部是卯榫结构。琉璃宝殿两边是仿五台山南禅寺大殿的大智殿和大悲殿， 极乐殿两边是大行殿和大愿殿。此四大殿供奉生漆脱胎、彩绘描金的文殊、普贤、观音、地藏四大菩萨。极乐宝殿之后是朝山会馆念佛堂，会馆东为般若堂。大智殿前院子里铺设了“九宫图”，按照传统文化“一坎二坤三震四巽五中六乾七兑八艮九离”的方位和顺序排布，按此顺序走一回可以祛病消灾，延年益寿。大行殿前院子里铺设了“海印图”，按照韩国海印寺高丽义湘祖师所悟《华严经》中的“海印三昧”的原理而造，绕走此图可以体验华严大教一多互具、重重无尽之玄理。整座寺庙建筑也体现了“向善守正，兼收并蓄，包容开放”的敦煌文化特征。
敦煌雷音寺属于汉传佛教，法脉属于法幢正宗，于1944年由近代佛教界大德高僧心道法师所创。目前是敦煌市境内规模最大的佛教活动场所，2013年被评为国家级3A级景区。现在的雷音寺已成为一个集信仰、弘法、修行、教育、佛教交流为一体的多功能佛 教文化场所。(王立军撰稿）
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